Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIM21P19474 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms