Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTPS1P17812 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms