Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3L1P16619 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms