Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CREB1P16220 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CREB1P16220 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms