Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA4P12838 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms