Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC166P0CW27 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms