Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PDE6DO43924 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDE6DO43924 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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