Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms