Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIP1O00291 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIP1O00291 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIP1O00291 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms