Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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