Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00862A6NCI5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms