Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
A4D1N5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
A4D1N5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
A4D1N5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
A4D1N5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms