Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPQ1

Glycine cleavage system H protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPQ1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A1W2PPQ1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A1W2PPQ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms