Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms