Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms