Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms