Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms