Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms