Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APEX2Q9UBZ4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APEX2Q9UBZ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms