Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms