Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ABRACLQ9P1F3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms