Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKIRAS1Q9NYS0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKIRAS1Q9NYS0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms