Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR3EQ9NVU0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms