Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L1Q9NU39 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms