Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTL1Q9NRR1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTL1Q9NRR1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTL1Q9NRR1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTL1Q9NRR1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTL1Q9NRR1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTL1Q9NRR1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTL1Q9NRR1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYTL1Q9NRR1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTL1Q9NRR1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms