Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FBXO8Q9NRD0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO8Q9NRD0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms