Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms