Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NRIP3Q9NQ35 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms