Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIMMDC1Q9NPL8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TIMMDC1Q9NPL8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms