Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3GQ9HC16 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms