Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELL3Q9HB65 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ELL3Q9HB65 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms