Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms