Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDC1Q9BTX1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms