Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRACR2AQ9BSW2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms