Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RTKNQ9BST9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms