Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC22CQ9BRL7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms