Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms