Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SORT1Q99523 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms