Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMKK2Q96RR4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMKK2Q96RR4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms