Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YTHDC1Q96MU7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YTHDC1Q96MU7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms