Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
JSRP1Q96MG2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms