Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms