Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RNF185Q96GF1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RNF185Q96GF1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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