Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTERF3Q96E29 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms