Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CCDC47Q96A33 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CCDC47Q96A33 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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