Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC102AQ96A19 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms