Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NKD1Q969G9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms