Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms