Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC4Q92889 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms