Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF12Q8WXF0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms